1.购买时间不同
电子式国债仅在发行期内可以购买，而凭证式国债在发行期内或者发行期后都可以购买。
2.起息日不同
国债起息日会被很多投资者忽视。两种债券的起息日不同，电子式国债有统一日期开始计息，这就意味着，即使你是本月10日购买到的债券，起息日有可能在本月的15日;而凭证式国债的起息日则是从投资人购买之日开始计息。
3.购买渠道不同
凭证式国债和电子式国债的购买渠道和手续不同，电子式国债既可以去银行网点购买，也可以通过网银买。而凭证式国债只能通过银行柜台买。
4.付息方式不同
凭证式国债到期一次性付息，电子式国债每年付息，最后一年支付本金。
1、投资者在购买储蓄国债（电子式）后，可以通过在柜台打印对账单或者拨打承办银行客户服务电话查询自己债权余额及变更情况。部分承办银行还为投资者提供了国债账户折，用于打印债权信息。2、中央国债公司建立电话语音债权复核查询系统，为投资者提供债权余额复核查询服务。（1）查询电话号码：010-66005000（400-666-5000）（2）查询初始密码：投资者身份识别码后六位，不足的前补0。应提醒投资者及时变更；如遗忘，到柜台办理查询密码恢复手续。（3）提供前一日及过去12个月任何一日日终余额查询，当日余额要到第二天才能查询。到期后自动划到银行的资金账户上，自己去柜台查询；电子国债是每年在付息日支付一年的利息。