普票和专票的税点没有区别，是一样的。但是在发票本身上它们也存在区别，首先是联次略有不同。增值税专用发票分为两联版和六联版；增值税普通发票分为两联版和五联版。清楚是管理的严格程度有差别。专票的开具和管理有一套严格的流程，比如，专票的存放必须用保险柜存放，对普票就没这要求。专用发票的开具要求也更高一些，必须字迹清楚，不得压线，错格，不然都可能被退回的。第三是进项抵扣有差异。普票不能抵扣进项，专用发票是可以抵扣进项的。
抵扣时，增值税专用发票能抵扣，增值税普通发票不可以抵扣。开具发票时，增值税专用发票需要购货方详细的资料信息，增值税普通发票则不需要。使用时，增值税专用发票是无限制时间的，增值税普通发票的使用期限是2个月。只有增值税一般纳税人才能开具增值税专用发票.作为既有普通发票又有增值税专用发票的单位来说,开具这两种发票所交的税都是一样的(两种发票税率是一样的).而作为接受发票的单位则不同,如果接受发票的单位是增值税一般纳税人,它接受增值税专用发票可以抵扣税金,而接受普通发票就不能抵扣税金.如果接受发票的单位是小规模纳税人,那么,不论它接受的是不是增值税专用发票,都不能抵扣税金.